تعترف النصوص التأسيسيّة للمؤسّسة المستقلّة المعنيّة بالمفقودين بالأبعاد الجنسانية العديدة لظاهرة الأشخاص المفقودين وتطالبها أن تؤسس جميع جوانب عملها في الشمولية الجنسانية وعدم التمييز. وكما هو مطلوب بموجب قرار تأسيسها، تواصل المؤسّسة التعامل مع المنظمات النسائيّة وروابط الضحايا التي تقودها النساء.